У нас защищённое приложение работает, если видит, что подключен только один НАШ ключ. Можно ли без использования GrdFind понять, что подключен только один наш ключ?

Добрый день. Вы можете выполнять функцию GrdLogin. И далее по коду возврата функциии делать вывод - подключён ли нужный ключ, или нет.
GrdFind при этом можно не использовать. Параметры ключа, с которым вы будете работать определяются функцией GrdSetFindMode.

...
- Нет смысла в рабочем приложении использовать GrdFind, т.к. он больше нужен чтобы перебрать все ключи в системе и составить список, причем не требует указания кодов доступа. Нужно использовать GrdLogin, поскольку эта функция уже будет искать конкретный ключ по параметрам, заданным для GrdSetFindMode и логиниться к нему, если найдет

У нас защищённое приложение работает, если видит, что подключен только один НАШ ключ. Можно ли без использования GrdFind понять, что подключен только один наш ключ?

Welcome to Guardant Diagnostic Tool! (v1.0001)       

Detecting Guardant dongles ...

------------- Guardant Code Time Dongle ---------------------------------------
  Produce Date (dd.mm.yy):                      21.05.2019 (ID=0xXXXXXXXX)     
  Versions (Hrw,MCUF,Type,PrtSup,Std,Cl,DSt):   0.1,00,5F0,00,00,0.0,0         
  Supports:                                     PI,TRU,RTC,AES,ECC,CODE       
  Global Flags:                                 PTIME                         
  Public Code:                                  XXXXXXX (0xXXXXXXXX)           
-------------------------------------------------------------------------------
Firmware  ProgNum  Version  SerialN GPcounter  Mask   NetRes RealRes  Index   
-------------------------------------------------------------------------------
1.0.2.21        0        1      109         0  0000h       0       0 00000000
-------------------------------------------------------------------------------
Result: 1 dongle(s) found. Press Enter...

C 31.01.2020 по сегодняшний день 04.02.2020 ключ работает без зависаний, в логах тестовой утилиты не было ни одного сбоя функций GrdCheck и GrdLogin. Понаблюдаем еще.

Для пользователя защищенного приложения, с точки зрения трудозатрат на настройку ключа в Linux, разницы не будет абсолютно, т.е. также нужно установить правило для udev и подключить ключ.

Переведите, пожалуйста, ключ в драйверный режим и также потестируйте.

Welcome to Guardant Diagnostic Tool! (v1.0001)       

Detecting Guardant dongles ...

Result: 0 dongle(s) found. Press Enter...

Причем функция Detecting Guardant dongles ... длилась около 23 секунд

Все время было запущено тестовое приложение которое обращалось к ключу и вот сейчас когда я решил снова замерить время работы утилиты chknsk и она вдруг обнаружила ключ. Посмотрел логи работы нашей тестовой утилиты, после многих неудачных попыток функция GrdLogin вдруг снова стала работать. Зависание продлилось с 20:03 вчерашнего дня по 10:45 сегодняшнего дня т.е. около 15 часов. Ключ вроде бы не трогали. Первыий раз такое "отвисание" произошло.

Welcome to Guardant Diagnostic Tool! (v1.0001)       

Detecting Guardant dongles ...

------------- Guardant Code Time Dongle ---------------------------------------
  Produce Date (dd.mm.yy):                      21.05.2019 (ID=0xXXXXXXXX)     
  Versions (Hrw,MCUF,Type,PrtSup,Std,Cl,DSt):   0.1,00,5F0,00,00,0.0,0         
  Supports:                                     PI,TRU,RTC,AES,ECC,CODE       
  Global Flags:                                 PTIME,HID                     
  Public Code:                                  XXX_XXX (0xXXXXXXXX)           
-------------------------------------------------------------------------------
Firmware  ProgNum  Version  SerialN GPcounter  Mask   NetRes RealRes  Index   
-------------------------------------------------------------------------------
1.0.2.21        0        1      104         0  0000h       0       0 00000000
-------------------------------------------------------------------------------
Result: 1 dongle(s) found. Press Enter...

Подождем когда ключ зависнет вновь и снова попытаемся ее выполнить.

По поводу хендлов. У нас используется первый описанный вами вариант. Над библиотекой grdapi написана дополнительная библиотека, которая работает непосредственно с ключем, в ней используется однин хендл. Перед выполнением любой функции GrdAPI происходит блокировка семафором, а вызовы фунукций GrdCodeRun дополнительно огорожены функциями GrdLock, GrdUnlock. Так же хотелось бы отметить, что обращение к ключу идет из нескольких процессов, в некоторых из них и из разных потоков.

Функции GrdFind и GrdLogin обращаются только к локальным ключам, так как перед их вызовом выполняется функция:
GrdSetFindMode(keyHandle, GrdFMR_Local, GrdFM_Type, 0, 0, 0, 0, 0, GrdDT_RTC, GrdFMM_CodeUSB, GrdFMI_USB);
Для поиска ключа мы действительно используем функцию GrdFind, а GrdLogin уже выполняется после успешного выполнения GrdFind. Учтем ваше предложение по поводу удаления функции GrdFind из кода, спасибо.
Мы провели эксперимент: после того как ключ уже находился в "зависшем" состоянии, было написано тестове приложение, в котором вместо вызова функции GrdFind была использована функция GrdLogin, но ее  выполнение так же происходит с ошибкой до тех пор пока не передернешь физически ключ.

Еще провели небольшой эксперимент на предмет того, что зависает ключ или драйвер. При "зависшем" ключе перезагрузили ПК, при этом с помощью осциллографа убедились, что питание на USB в момент перезагрузки не обрывалось. Так вот после перезагрузки ключ прекрасно начал работать, т.о. предположительно что-то в драйвере ключа происходит.

Ключи у нас работают в HID режиме.

Посоветовались с нашими разработчиками, чтобы попытаться хотя бы предположить причины описанного поведения. Поскольку данных в описании мало, а тест с исходниками получить затруднительно, то есть пара гипотез «куда копать», связанных с многопоточностью:

1. Если используется один handle на все потоки, то можно попробовать лочить его мьютексом пока выполняется GrdCodeRun. Либо в каждом потоке создавать отдельный хэндл
2. Если в каждом потоке отдельный handle, то надо наоборот попробовать держать один хэндл на все потоки

Есть вероятность что в одном из этих кейсов проблема уйдет.

ОБРАТИТЬ ВНИМАНИЕ

- Надо убедиться, что GrdFind и GrdLogin ищут только локальные ключи
- Нет смысла в рабочем приложении использовать GrdFind, т.к. он больше нужен чтобы перебрать все ключи в системе и составить список, причем не требует указания кодов доступа. Нужно использовать GrdLogin, поскольку эта функция уже будет искать конкретный ключ по параметрам, заданным для GrdSetFindMode и логиниться к нему, если найдет
- Как раз вы не описали в какой момент выполняется GrdLogin? В случае сбоя до ее вызова, видимо, дело не доходит
- Еще интересно в каком режиме используете ключи, USB или HID?