Сама по себе защита базового блока примерно в 800 раз замедляет его выполнение. Но это замедление может быть нивелировано, если правильно подобрана частота вызова защищённых  блоков в единицу времени работы приложения.

Что касается замедлений автозащиты, то первое замедление происходит при старте защищённого приложения в момент расшифровки в памяти и далее в моменты вызовов защищённых импортов и RIP-кода. Сам по себе вызов защищённого импорта или RIP-кода занимает фиксированное время. Тем не менее, слишком частые вызовы также могут привести к резкому замедлению.

Далее, рекомендуется использовать Guardant Armor. В этом случае движок на сервере распознает наш объектный файл в вашем приложении, и преобразует его вместе с кодом приложения в псевдокод. Псевдокод шифруется на электронном ключе, и будет расшифровываться блоками по мере выполнения, при этом в памяти никогда не будет всех блоков сразу (защита от дампа). Плюс нельзя будет поставить точки останова на API внутри приложения, и т.д. Т.е. полноценная защита с помощью виртуальной машины с привязкой к ключу. Является самым стойким автоматическим средством на текущий момент.