Это частное явление и, судя по накопленной нами статистике, достаточно редкое. Больше всего обращений (несколько десятков), связанных с перебоями в работе электронных ключей при использовании USB 3.0, поступало к нам тогда, когда данный стандарт только начинал внедрятся в массовом сегменте ПК и то, проблемы наблюдались лишь на некоторых USB-контроллерах.

Это нормальное поведение для HID-ключа на USB 3.0 или же это какая-то крайне редкая особенность моего компьютера? Т.е. как часто возникает такая проблема?

У меня лицензионная Windows 8.1 x64 с последними обновлениями. Ключ прошивался утилитой из SDK 6.31.