У меня на компе установлена программа и к ней ключ USB, каждый раз для включения программы мне необходимо включить сервер ключа, пожалуйста подробнее опишите, как мне сделать автозагрузку?

Процесс добавления программ в автозагрузку в Windows достаточно стандартный, прочитать про него можно, например, тут.

Сервер сетевых ключей Guardant Net можно зарегистрировать в системе как Windows-сервис (из командной строки запустить сервер с параметром "/s"), или автоматически запускать как приложение, добавив его в автозагрузку.